Ingénieur / Ingénieure de recherche scientifique (H/F)

Mission :

L'agent sera chargé de contribuer à l'animation technique et scientifique du PT1 (Pôle Transverse Génomique Environnementale) du PEPR DYNABIOD, en appui de Lucie Zinger, responsable scientifique du pôle génomique et sous la supervision de Stephen Mulero, au Laboratoire d'Écologie Alpine. Il/elle assurera :

• L'animation et la coordination au sein du réseau des partenaires du PT1, en lien avec l'ensemble des acteurs impliqués.
• Le suivi rigoureux des expérimentations réalisées dans le cadre de DYNABIOD, en particulier au LECA, en appui des équipes locales.
• Le développement et l'optimisation de workflows de biologie moléculaire pour traiter les échantillons des projets ciblés et du PT1.
• La gestion des flux d'échantillons, la coordination entre les partenaires du PT1, et les arbitrages techniques nécessaires à la bonne exécution des projets.
• Un rôle à responsabilités allant au-delà de la simple réalisation de manipulations en laboratoire.

Activités :

Animation et coordination du PT1 :

• Participer à l'organisation et à l'animation des activités du réseau des partenaires du PT1.
• Assurer la coordination entre les partenaires pour harmoniser les pratiques et résoudre les blocages techniques.
• Contribuer aux prises de décision pour les arbitrages techniques et la gestion des priorités.

Suivi et optimisation des manipulations :

• Superviser et assurer le suivi des expérimentations réalisées chez les partenaires, en particulier au LECA, en interaction avec la responsable scientifique du pôle et un autre agent dédié à Dynabiod et basé au CRBE (Toulouse).
• Proposer des améliorations pour les protocoles de biologie moléculaire (extraction ADN, préparation de librairies, séquençage) afin d'optimiser les flux d'échantillons.
• Anticiper les besoins liés à l'augmentation du volume d'échantillons à traiter.

Développement méthodologique :

• Adapter et optimiser les protocoles pour répondre aux exigences des projets ciblés du PEPR DYNABIOD.
• Organiser et participer à des tests inter-laboratoires pour valider de nouvelles méthodes ou technologies (ex : séquençage haut débit, automatisation).
• Documenter les procédures et contribuer à la rédaction de guides de bonnes pratiques et de protocoles standardisés.
• Centraliser les informations relatives aux expérimentations et aux documents techniques associés.

Gestion des flux et mutualisation :

• Superviser la logistique (stockage ADN, gestion des équipements mutualisés, robotique).
• Participer à la montée en puissance des plateformes partenaires pour répondre aux besoins du projet.

Veille et collaboration :

• Maintenir une veille scientifique et technologique dans le domaine de la génomique environnementale.
• Représenter le PT1 dans les instances nationales dans lesquelles figure le PEPR DYNABIOD